貨物申報進口時，進口貨物收貨人或者其代理人應當按照海關的申報規定填制“中華人民共和國海關進口貨物報關單”，申明適用協定稅率或者特惠稅率，并同時提交貨物的有效原產地證書正本，或者相關優惠貿易協定規定的原產地聲明文件，貨物的商業發票正本、運輸單證等其他商業單證。貨物經過其他國家或者地區運輸至中國境內的，還應當提交證明符合《中華人民共和國海關進出口貨物優惠原產地管理規定》(以下簡稱《優惠原產地管理規定》)有關規定的聯運提單等證明文件；在其他國家或者地區臨時儲存的，還應當提交該國家或者地區海關出具的證明符合《優惠原產地管理規定》有關規定的其他文件。進口貨物收貨人或者其代理人向海關提交的原產地證書，應當符合相應優惠貿易協定關于證書格式、填制內容、簽章、提交期限等規定，并與商業發票、報關單等單證的內容相符。
原產地申報為優惠貿易協定成員國或者地區的貨物，進口貨物收貨人及其代理人未依照《優惠原產地管理規定》有關規定提交原產地證書、原產地聲明的，應當在申報進口時就進口貨物是否具備相應優惠貿易協定成員國或者地區原產資格，按《優惠原產地管理規定》有關規定的格式要求向海關進行補充申報。海關可以根據進口貨物收貨人或者其代理人的申請，按照協定稅率或者特惠稅率收取等值保證金后放行貨物，并按照規定辦理進口手續、進行海關統計。
海關認為需要對進口貨物收貨人或者其代理人提交的原產地證書的真實性，以及貨物是否原產于優惠貿易協定成員國或者地區進行核查的，按照該貨物適用的最惠國稅率、普通稅率或者其他稅率收取相當于應繳稅款的等值保證金后放行貨物，并按照規定辦理進口手續，進行海關統計。海關認為必要時，可以請求出口成員國或者地區主管機構對優惠貿易協定項下進口貨物原產地進行核查，也可以依據相應優惠貿易協定的規定就貨物原產地開展核查訪問。
有下列情形之一的，進口貨物不適用協定稅率或者特惠稅率：
1．進口貨物收貨人或者其代理人在貨物申報進口時沒有提交符合規定的原產地證書、原產地聲明，也未就進口貨物是否具備原產資格進行補充申報的；
2．進口貨物收貨人或者其代理人未提供商業發票、運輸單證等其他商業單證，也未提交其他證明符合《優惠原產地管理規定》第十四條規定的文件的；
3．經查驗或者核查，確認貨物原產地與申報內容不符，或者無法確定貨物真實原產地的；
4．其他不符合《優惠原產地管理規定》及相應優惠貿易協定規定的情形。
